Можно ли записывать аудио с дополнительного аудиоустройства в хранилище на жестком диске (HDD Jukebox)?

Да. Подключите внешнее аудиоустройство к аналоговому (ANALOG IN) или цифровому (DIGITAL IN) входу, и звук можно будет записывать.
Однако запись через цифровой вход (DIGITAL IN) невозможна, если цифровой сигнал из источника защищен от цифрового копирования*.

* Выходные цифровые сигналы с записанных цифровым способом мини-дисков, лент DAT или цифровых тюнеров BS/CS с защитой от копирования и т. д.